個人親子鑒定和司法親子鑒定的檢測標準和判斷標準一樣。不同之處有： 條件不同：個人親子鑒定只要需要提供合格的樣本即可；司法親子鑒定需要被鑒定人在場并提供有效身份證明。 用途不同：個人親子鑒定只能作為個人參考；司法親子鑒定不僅可以作為個人知情，還能有司法效力，如可以用于上戶、遷戶、辦理出生醫學證明、法律用途。 報告內容不同：個人親子鑒定僅有DNA數據、分析說明和結論；司法親子鑒定不僅有DNA數據、分析說明和結論，還有被鑒定人身份信息、身份證明、照片，鑒定所的司法許可證明、鑒定人執業資格證明。 報告章不同：個人親子鑒定僅有DNA鑒定專用章；司法親子鑒定加蓋司法鑒定專用章鋼印和鮮紅章。 報告數量不同：個人親子鑒定一般標準只有一份咨詢檢測報告；司法親子鑒定一般會有一正兩副三份司法檢驗報告。當然都可以增加報告數量，但是都會產生費用，所有個人親子鑒定與司法親子鑒定費用也有少許差別。
