親子鑒定是可以只和父親做的。而且目前親子鑒定80%以上是只和父親做的。
父母子三人做親子鑒定為三聯體親子鑒定，父子或母子親子鑒定為二聯體親子鑒定。二聯體親子鑒定一般存在單親風險。如果出現單親風險時，將不能給出鑒定意見。此時如果需要給出鑒定意見的，有兩種方案：一是提供未參與方面的樣本做父母子三聯體親子鑒定，二是參與單親親子鑒定的兩個人同時增加檢測到40個位點。
簡單的講：父母子三人親子鑒定是兩種鑒定結果-肯定或是否定；但是父子或是母子二人做親子鑒定存在三種結果-肯定或是否定，還有少部分是不確定的。不能確定的情況就是不能滿足親子鑒定行業的國家控制的標準所有位點都符合遺傳規律且累計父權指數大于9999的，即親權概率大于99.99%的。即使是出現親權概率大于9998，即親權概率大于99.98%都是不能給出鑒定意見的，如果是司法親子鑒定給不了滿足標準的鑒定意見將出具不了司法檢驗報告，如果是個人親子鑒定可以出具沒有鑒定意見只有被鑒定人DNA數據的DNA檢測書，當事人接受99.98%的概率就好，這種概率加測后肯定是能給出結果是肯定的意見的。
