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水稻基因組項目完成后，2002年4月，另一本世界頂級刊物《科學》雜志 以14頁的篇幅發表了《水稻f(和lJ稻)基因組工作框架序列圖}，并配以大量的評論文章，高度評價該工作是對世界科學乃至全人類里程碑式的貢獻。這次，鄧亞軍的名字和個人專訪也出現在《科學》雜志上。
文章一發表，在國內再度引起關注，很多媒體記者與華大方面聯系，希望能采訪鄧亞軍，但讓人意外的是，這時誰都聯系不上她一一原來此時她已經返回西安，準備自己的論文答辯去了。
沒錯，這時的鄧亞軍，盡管已經經過兩大重點項目的錘煉，但尚未獲得碩士18 文憑。以一個在讀碩士的條件，在這么大的項目中擔任主管，在中國這樣一個講-求資歷與背景的環境下，需要面對的挑戰和背后的辛苦，就只有她自己才能體會了。
經過這兩年在北京的摸爬滾打后，繼續攻讀博士學位、在DNA鑒定領域走得更遠也是鄧亞軍給自己定下的目標，在順利拿到碩士文憑后，她又獲得西安醫科大學的博士錄取資格，然而這次她的工作單位濡橋分局卻沒有再支持她。
在2002年的西安市公安局濡橋分局，碩士畢業的鄧亞軍已經算是分局學歷最高的警察。參加完超級雜交稻基因組計劃后，中央電視臺采訪了鄧亞軍，這期采訪播出后在濡橋分局引起了不小的震動，分局的同事誰也沒有想到當初那個看上去風風火火的小姑娘，不僅能做好法醫的事，還能參與到這么尖端的國際項目中去。
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